Сформирован 35-й Мургабский ПОГО (24.07.1973) 24 июля 1973 года сформирован 35-й Мургабский пограничный отряд Восточного ПО (на базе комендатуры 131-го Ошского пограничного отряда) В 1980-1985 годах подразделения отряда принимали участие в боевых действиях на территории Афганистана. С 1985 году отряд подчинен Оперативно-войсковой группе Восточного ПО. В период с 1992 по 2004 год отряд входил в состав Группы пограничных войск РФ в Республике Таджикистан. В 2004 году отряд передан в состав Комитета по охране госграницы Республики Таджикистан.